{"id":59037,"date":"2021-04-09T09:10:42","date_gmt":"2021-04-09T12:10:42","guid":{"rendered":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/?p=59037"},"modified":"2021-04-09T09:10:42","modified_gmt":"2021-04-09T12:10:42","slug":"novo-metodo-agiliza-o-monitoramento-de-variantes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/novo-metodo-agiliza-o-monitoramento-de-variantes\/","title":{"rendered":"Novo m\u00e9todo agiliza o monitoramento de variantes"},"content":{"rendered":"

Acaba de ser desenvolvida na Fiocruz Pernambuco uma metodologia que visa tornar mais simples e \u00e1gil, al\u00e9m de mais barato, o monitoramento das variantes do novo coronav\u00edrus. \u00c9 baseada em uma t\u00e9cnica que j\u00e1 \u00e9 largamente utilizada e dispon\u00edvel no Brasil e no mundo, o sequenciamento de Sanger – tamb\u00e9m denominado sequenciamento por eletroforese capilar. O artigo com esse achado acaba de ser disponibilizado online como preprint na\u00a0plataforma MedRxiv<\/a>.<\/p>\n

O teste foi elaborado pela equipe da Fiocruz Pernambuco que realiza o monitoramento de novas variantes do Sars-CoV-2 no estado, utilizando infraestrutura e tecnologia de ponta dispon\u00edveis no Laborat\u00f3rio de N\u00edvel de Biosseguran\u00e7a 3 (NB3) e no N\u00facleo de Plataformas Tecnol\u00f3gicas (NPT) da institui\u00e7\u00e3o. O trabalho \u00e9 realizado a partir de amostras fornecidas pelo Lacen\/PE, sob encomenda da Secretaria de Sa\u00fade do Estado de Pernambuco (SES\/PE). O grupo integra tamb\u00e9m a Rede de Monitoramento Gen\u00f4mico da Covid-19 da Funda\u00e7\u00e3o Oswaldo Cruz.<\/p>\n

Este trabalho que assume uma maior relev\u00e2ncia quando se observa a o surgimento e espalhamento das novas variantes e o recrudescimento da pandemia no Brasil e no mundo. A explos\u00e3o de casos de Covid-19 observada em todo o Brasil no m\u00eas de mar\u00e7o, por exemplo, est\u00e1 relacionada \u00e0 variante P.1, identificada inicialmente no estado do Amazonas, que vem se espalhando rapidamente pelo pa\u00eds.<\/p>\n

\u201c\u00c9 muito importante que a P.1, assim como todas as outras variantes do novo coronav\u00edrus, sejam continuamente monitoradas. Esses dados s\u00e3o fundamentais para o combate \u00e0 doen\u00e7a, tanto do ponto de vista epidemiol\u00f3gico, quanto na adapta\u00e7\u00e3o das novas vacinas e de testes diagn\u00f3sticos\u201d, ressalta o t\u00e9cnico em Sa\u00fade P\u00fablica da Fiocruz Pernambuco, Matheus Figueira Bezerra, autor principal do artigo. A publica\u00e7\u00e3o tem como coautores outros profissionais e uma aluna da p\u00f3s-gradua\u00e7\u00e3o em Bioci\u00eancias e Biotecnologia em Sa\u00fade, todos da institui\u00e7\u00e3o: os pesquisadores Gabriel Wallau (Entomologia e Bioinform\u00e1tica), Marcelo Paiva (Entomologia), C\u00e1ssia Docena (NPT), Sinval Brand\u00e3o Filho (Imunologia), Const\u00e2ncia Ayres (Entomologia), a t\u00e9cnica\u00a0 Viviane Carvalho (NPT) e a doutoranda em BBS La\u00eds Ceschini Machado.<\/p>\n

O estudo aponta que o sequenciamento completo do genoma viral, considerado hoje o padr\u00e3o ouro para identifica\u00e7\u00e3o dessas variantes, tem uma execu\u00e7\u00e3o complexa, apresentando algumas dificuldades ao ser aplicado na vigil\u00e2ncia epidemiol\u00f3gica da pandemia. O custo por amostra \u00e9 elevado, principalmente em um momento em que a moeda brasileira est\u00e1 desvalorizada. A quantidade de laborat\u00f3rios no Brasil (e no mundo) que tem um sequenciador de nova gera\u00e7\u00e3o n\u00e3o \u00e9 suficiente para atender \u00e0 demanda atual. O procedimento para realizar o sequenciamento completo do genoma viral \u00e9 demorado e a interpreta\u00e7\u00e3o dos resultados \u00e9 complexa, sendo necess\u00e1rio o trabalho de profissionais especializados em Bioinform\u00e1tica e o uso de computadores com alta capacidade de processamento de dados, fazendo com que os resultados demorem at\u00e9 semanas para ficar prontos. Al\u00e9m de tudo isso, alguns itens necess\u00e1rios para o sequenciamento est\u00e3o em falta nos fornecedores pela alta demanda, o que dificulta o trabalho dos pesquisadores.<\/p>\n

Matheus explica que, para contornar essas dificuldades, foi escolhido um trecho pequeno do genoma do v\u00edrus para ser sequenciado, que cont\u00e9m informa\u00e7\u00f5es suficientes para diferenciar as variantes entre si, sem precisar sequenciar as 29 mil bases que comp\u00f5e o genoma completo do Sars-CoV-2. Muitas das muta\u00e7\u00f5es-chave encontradas nessas variantes mais transmiss\u00edveis do v\u00edrus acontecem em uma regi\u00e3o especifica do gene S. \u201cAp\u00f3s definirmos qual trecho analisar\u00edamos, aplicamos o m\u00e9todo em amostras das linhagens P.1, P.2 e B1.1 (esta \u00faltima utilizada como controle, ou seja, n\u00e3o apresenta as muta\u00e7\u00f5es mais importantes atualmente detectadas nas linhagens de preocupa\u00e7\u00e3o) e comparamos os resultados obtidos com o protocolo de sequenciamento gen\u00f4mico, e observamos que houve 100% de concord\u00e2ncia\u00a0 entre eles\u201d.<\/p>\n

A grande vantagem dessa t\u00e9cnica \u00e9 que ela pode ser executada com um aparato tecnol\u00f3gico mais simples, o sequenciamento por eletroforese capilar (ou sequenciamento de Sanger). Al\u00e9m de ser mais r\u00e1pida, simples e barata, a disponibilidade desses equipamentos \u00e9 bem maior que dos sequenciadores de nova gera\u00e7\u00e3o.<\/p>\n

O cientista ressalta que a ideia n\u00e3o \u00e9 substituir o sequenciamento completo do genoma, pois \u00e0 medida que o v\u00edrus vai evoluindo, outras variantes v\u00e3o surgir e ser\u00e1 necess\u00e1ria a cobertura completa desses genomas. \u201cO objetivo do nosso m\u00e9todo \u00e9 na verdade possibilitar que o monitoramento das variantes seja realizado em uma escala bem maior de amostras, com redu\u00e7\u00e3o significativa no tempo e custo de processamento\u201d, resume.<\/p>\n

A divulga\u00e7\u00e3o desse teste visa permitir que sua metodologia possa ser amplamente conhecida e adotada pelo maior n\u00famero de laborat\u00f3rios. Isso pode agilizar os resultados desse tipo de an\u00e1lise e fornecer aos gestores da Sa\u00fade informa\u00e7\u00f5es de forma mais r\u00e1pida sobre a ocorr\u00eancia dessas variantes, para embasar a tomada de decis\u00f5es e a ado\u00e7\u00e3o das medidas sanit\u00e1rias pelos governos municipais, estaduais e federal.<\/p>\n

Fonte: Associa\u00e7\u00e3o M\u00e9dica de Pernambuco (AMPE)<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Acaba de ser desenvolvida na Fiocruz Pernambuco uma metodologia que visa tornar mais simples e \u00e1gil, al\u00e9m de mais barato, o monitoramento das variantes do novo coronav\u00edrus. \u00c9 baseada em uma t\u00e9cnica que j\u00e1 \u00e9 largamente utilizada e dispon\u00edvel no Brasil e no mundo, o sequenciamento de Sanger – tamb\u00e9m denominado sequenciamento por eletroforese capilar. […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ocean_post_layout":"","ocean_both_sidebars_style":"","ocean_both_sidebars_content_width":0,"ocean_both_sidebars_sidebars_width":0,"ocean_sidebar":"","ocean_second_sidebar":"","ocean_disable_margins":"enable","ocean_add_body_class":"","ocean_shortcode_before_top_bar":"","ocean_shortcode_after_top_bar":"","ocean_shortcode_before_header":"","ocean_shortcode_after_header":"","ocean_has_shortcode":"","ocean_shortcode_after_title":"","ocean_shortcode_before_footer_widgets":"","ocean_shortcode_after_footer_widgets":"","ocean_shortcode_before_footer_bottom":"","ocean_shortcode_after_footer_bottom":"","ocean_display_top_bar":"default","ocean_display_header":"default","ocean_header_style":"","ocean_center_header_left_menu":"","ocean_custom_header_template":"","ocean_custom_logo":0,"ocean_custom_retina_logo":0,"ocean_custom_logo_max_width":0,"ocean_custom_logo_tablet_max_width":0,"ocean_custom_logo_mobile_max_width":0,"ocean_custom_logo_max_height":0,"ocean_custom_logo_tablet_max_height":0,"ocean_custom_logo_mobile_max_height":0,"ocean_header_custom_menu":"","ocean_menu_typo_font_family":"","ocean_menu_typo_font_subset":"","ocean_menu_typo_font_size":0,"ocean_menu_typo_font_size_tablet":0,"ocean_menu_typo_font_size_mobile":0,"ocean_menu_typo_font_size_unit":"px","ocean_menu_typo_font_weight":"","ocean_menu_typo_font_weight_tablet":"","ocean_menu_typo_font_weight_mobile":"","ocean_menu_typo_transform":"","ocean_menu_typo_transform_tablet":"","ocean_menu_typo_transform_mobile":"","ocean_menu_typo_line_height":0,"ocean_menu_typo_line_height_tablet":0,"ocean_menu_typo_line_height_mobile":0,"ocean_menu_typo_line_height_unit":"","ocean_menu_typo_spacing":0,"ocean_menu_typo_spacing_tablet":0,"ocean_menu_typo_spacing_mobile":0,"ocean_menu_typo_spacing_unit":"","ocean_menu_link_color":"","ocean_menu_link_color_hover":"","ocean_menu_link_color_active":"","ocean_menu_link_background":"","ocean_menu_link_hover_background":"","ocean_menu_link_active_background":"","ocean_menu_social_links_bg":"","ocean_menu_social_hover_links_bg":"","ocean_menu_social_links_color":"","ocean_menu_social_hover_links_color":"","ocean_disable_title":"default","ocean_disable_heading":"default","ocean_post_title":"","ocean_post_subheading":"","ocean_post_title_style":"","ocean_post_title_background_color":"","ocean_post_title_background":0,"ocean_post_title_bg_image_position":"","ocean_post_title_bg_image_attachment":"","ocean_post_title_bg_image_repeat":"","ocean_post_title_bg_image_size":"","ocean_post_title_height":0,"ocean_post_title_bg_overlay":0.5,"ocean_post_title_bg_overlay_color":"","ocean_disable_breadcrumbs":"default","ocean_breadcrumbs_color":"","ocean_breadcrumbs_separator_color":"","ocean_breadcrumbs_links_color":"","ocean_breadcrumbs_links_hover_color":"","ocean_display_footer_widgets":"default","ocean_display_footer_bottom":"default","ocean_custom_footer_template":"","ocean_post_oembed":"","ocean_post_self_hosted_media":"","ocean_post_video_embed":"","ocean_link_format":"","ocean_link_format_target":"self","ocean_quote_format":"","ocean_quote_format_link":"post","ocean_gallery_link_images":"on","ocean_gallery_id":[]},"categories":[9],"tags":[1420,1490,82],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/59037"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=59037"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/59037\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":59038,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/59037\/revisions\/59038"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=59037"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=59037"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.simepe.com.br\/novo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=59037"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}